المواد الملوثة للبيئة المائية كما عرفها القانون البيئي المصري مادة (1) : هى أية مواد يترتب علي تصريفها في البيئة المائية بطريقة إرادية أو غير إرادية تغيير في خصائصها أو الاسهام في ذلك بطريقة مباشرة أو غير مباشرة علي نحو يضر بالانسان أو بالموارد الطبيعية أو بالمياة البحرية أو تضر بالمناطق السياحية أو تتداخل مع الاستخدامات الأخري المشروعة للبحر و يندرج تحت هذه المواد : ( أ ) الزيت أوالمزيج الزيتي ( ب ) المخلفات الضارة و الخطرة المنصوص عليها في الاتفاقيات الدولية التي ترتبط بها جمهورية مصر العربية ( ج ) أية مواد أخري ( صلبة – سائلة – غازية ) وفقا لما تحدده اللائحة التنفيذية لهذا القانون ( د ) النفايات و السوائل غير المعالجة المتخلفة من المنشآت الصناعية (ه ) العبوات الحربية السامة ( و ) ما هو منصوص عليه في الا تفاقية و ملاحقها وهناك العديد من الملوثات التي يؤثر تواجدها على مدى صلاحية وملائمة البيئة المائية لتربية الأسماك ومن هذه الملوثات المعادن الثقيلة مثل " الرصاص ، الزئبق ، النحاس ، الزنك ، الكلوروهيدركربونيه ، التلوث بالزيت ، سواء بالزيت الخام أو المكرر وغيرها . وعامة يجب أن تكون البيئة المائية للاستزراع السمكي خاليه من هذه الملوثات أو على الأقل أن يكون تركيزها ضمن الحدود المسموح بها واستخدام خزانات المياه المناسبة بالإضافة إلى مضخات الهواء والماء ووجود نظام التبريد الصحراوي والتخلص من الملوثات . وأضرار تلوّث المياه لتلوّث المياه أضرار كثيرة منها: تسمم الأحياء المائية، ونقص الأكسجين المذاب في الماء، وظهور الكثير من الأمراض عند الإنسان بسبب وجود أنواع عديدة من البكتيريا والطفيليات.