تُصنّف مجموعات المكتبة الرقميّة ليُسهّل على المُستخدم الإبحار خلالها، و أن يتحرك المُستخدم في مجموعات ويتنقل من مجال موضوعي إلى آخر مُتفرّع عنه ومن العام إلى الخاص إلى الأخص حتى يجد ما يبحث عنه من معلومات وتُصنّف المجموعات بخطة تصنيف مثل تصنيف ديوي العشري، أو التصنيف العشري العالمي أو أي تصنيف يُناسب المجموعات ويُمكن أن تُصنَّف المجموعات وفق خطَّة تصنيف خالية من الرمز يُسمّى ذلك تبويبًا يتم بها تصنيف المجموعات إمَّا يدويًا بالكامل أو نصف آلي أو آليًا بالكامل أضف الي ذلك تنظيم المكتبات الرقمية وموارد المعلومات الإلكترونية، إلَّاأنَّه يُعرف منذ القدم باسم الفهرس فالبيانات التي يتكون منها الفهرس هي بيانات تصف بيانات أُخرى حول تصنيف وتنظيم المكتبات حاضرت الدكتورة سالي محي الدين محاضرات اليوم الثالث من فعاليات الورشة التدريبية "فهرسة وتصنيف المكتبات "التي تقدمها وتنفذها الإدارة المركزية للتدريب وإعداد القادة الثقافيين بالتعاون مع إقليم القاهرة الكبرى والمنفذ بقصر ثقافة الجيزة .